摘要:醫(yī)學圖像分析主要包含的模式識別任務是檢測定位分割配準分類。面臨挑戰(zhàn)作者簡述了深度學習用于醫(yī)學圖像分析面臨的挑戰(zhàn),主要有缺少較精確的標注數(shù)據(jù)。關注能對醫(yī)學圖像分析帶來啟發(fā)的其他計算機視覺機器學習領域的新工作。
今天arXiv新上一篇論文《Going Deep in Medical Image Analysis: Concepts, Methods, Challenges and Future Directions》,來自澳大利亞埃迪斯科文大學的研究人員綜述了深度學習在醫(yī)學圖像分析領域應用的概念、最近出現(xiàn)的常用方法、數(shù)據(jù)集、面臨挑戰(zhàn)和可能的未來方向
其參考了近幾年三百多篇文獻,值得醫(yī)學影像處理領域的學者與工程技術人員參考。
深度學習基礎
該論文首先從深度學習的基礎概念介紹,介紹了該領域的常用方法,包括深度學習網(wǎng)絡架構、神經(jīng)元概念、卷積神經(jīng)網(wǎng)絡、循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡等。
深度神經(jīng)網(wǎng)絡架構,包含輸入層、輸出層,與多個隱含層。
單個神經(jīng)元數(shù)學計算模型示例:
卷積操作示例:
網(wǎng)絡中卷積層計算圖示:
RNN模型圖示:
技術分類與文獻索引
作者按照醫(yī)學圖像分析的技術方向和應用場景(使用的數(shù)據(jù)集)歸納成下圖。
醫(yī)學圖像分析主要包含的模式識別任務是檢測/定位、分割、配準、分類。常見的醫(yī)學影像包括Brain、Breast、Eye、Chest、Abdomen等。
作者將2016、2017年新出的文獻按照谷歌學術的索引排序,列出了每個技術領域具有影響力的文章。(因2018年剛過,數(shù)據(jù)還不完整,所以不包含2018年的論文)
這些文獻在本文以索引出現(xiàn),想要進一步了解的同學可以文末下載原論文參考。
檢測/定位方向的高引文獻:
分割方向的高引文獻:
配準方向的高引文獻:
分類方向的高引文獻:
數(shù)據(jù)集
醫(yī)學影像的數(shù)據(jù)往往比較難以獲取,數(shù)據(jù)規(guī)模也比較小。
作者將該領域常用數(shù)據(jù)集總結列表如下:
下載網(wǎng)址及方法請參考原論文。
面臨挑戰(zhàn)
作者簡述了深度學習用于醫(yī)學圖像分析面臨的挑戰(zhàn),主要有:
1.缺少較精確的標注數(shù)據(jù)。醫(yī)學領域?qū)俗⒌囊蟾摺?/p>
2.樣本不平衡。正負樣本往往數(shù)量差異較大。
3.預測結果置信度信息缺失。醫(yī)學領域?qū)δP涂山忉屝缘囊蟾摺?/p>
未來方向
1.處理小數(shù)據(jù)問題。一些有用的技術包括使用遷移學習、數(shù)據(jù)增廣、GAN樣本生成。
2.結合更多數(shù)據(jù)來源。醫(yī)學領域往往不僅僅依靠圖像來診斷,結合病歷資料的多模態(tài)學習也值得關注。
3.關注其他領域的工作。關注能對醫(yī)學圖像分析帶來啟發(fā)的其他計算機視覺、機器學習領域的新工作。
論文地址:
https://arxiv.org/abs/1902.05655v1
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