資訊專欄INFORMATION COLUMN
本文關(guān)鍵給大家介紹了python大數(shù)據(jù)可視化制作火山圖實(shí)例詳細(xì)說(shuō)明，感興趣的小伙伴可以參考借鑒一下，希望可以有一定的幫助，祝愿大家多多的發(fā)展，盡早漲薪
導(dǎo)進(jìn)控制模塊
importnumpyasnp importpandasaspd
1.載入測(cè)試報(bào)告
data=pd.read_csv(r'E:ZYHR.projectrna-seqlianxi1exon_leveldf.csv')
2.查詢數(shù)據(jù)
data.head()
3.挑選差異基因
#3.試著寫(xiě)循環(huán)系統(tǒng)挑選上下降遺傳基因歸類取值給"up"和"down"和"nosig"添加pvalue標(biāo)準(zhǔn) ###loc函數(shù)：根據(jù)行檢索"Index"中的實(shí)際值去取行數(shù)據(jù)信息（如取"Index"為"A"的行） data.loc[(data.log2FoldChange>1)&(data.padj<0.05),'type']='up' data.loc[(data.log2FoldChange<-1)&(data.padj<0.05),'type']='down' data.loc[(abs(data.log2FoldChange)<=1)|(data.padj>=0.05),'type']='nosig'
4.查詢數(shù)據(jù),發(fā)覺(jué)多了type這某列
data.head()
5.統(tǒng)計(jì)個(gè)數(shù)
data.type.value_counts() up123 down103 Name:type,dtype:int64 data.type.value_counts() up123 down103 Name:type,dtype:int64
6.繪火山圖
importseabornassns
importmath
importmatplotlib.pyplotasplt
importmatplotlibasmpl
%matplotlibinline
#對(duì)padj取個(gè)-log10多數(shù)
data['-logpadj']=-data.padj.apply(math.log10)
#查詢
data[['log2FoldChange','padj','type','-logpadj']].head()
#先調(diào)整一下你的顏色
colors=["#01c5c4","#ff414d","#686d76"]
sns.set_palette(sns.color_palette(colors))
#制圖
ax=sns.scatterplot(x='log2FoldChange',y='-logpadj',data=data,
hue='type',#色調(diào)投射
edgecolor=None,#點(diǎn)界限色調(diào)
s=8,#點(diǎn)尺寸
)
#標(biāo)識(shí)
ax.set_title("vocalno")
ax.set_xlabel("log2FC")
ax.set_ylabel("-log10(padj)")
#挪動(dòng)圖示部位
ax.legend(loc='centerright',bbox_to_anchor=(0.95,0.76),ncol=1)
7.存圖
fig=ax.get_figure()
fig.savefig('./python_vocalno.pdf')
綜上所述，這篇文章就給大家介紹到這里了，希望可以給大家?guī)?lái)幫助。
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摘要：下面，作者介紹了八種在中實(shí)現(xiàn)的可視化工具包，其中有些包還能用在其它語(yǔ)言中。當(dāng)提到這些可視化工具時(shí)，我想到三個(gè)詞探索數(shù)據(jù)分析。還可以選擇樣式，它模擬了像和等很流行的美化工具。有很多數(shù)據(jù)可視化的包，但沒(méi)法說(shuō)哪個(gè)是最好的。 showImg(https://segmentfault.com/img/remote/1460000019029121); 作者：Aaron Frederick 喜歡用...
本文主要是給大家介紹了python大數(shù)據(jù)可視化制作全球人口地形圖的實(shí)例詳細(xì)說(shuō)明，感興趣的小伙伴可以參考借鑒一下，希望可以有一定的幫助，祝愿大家盡可能發(fā)展，盡早漲薪 序言 信息來(lái)源：population_data.json, 先看看數(shù)據(jù)信息長(zhǎng)什么樣 [ { "CountryName":"ArabWorld", "Country...
摘要：最終證明，及其相關(guān)工具的效率很高，但就演示而言它們并不是最好的工具。我按編號(hào)用顏色編碼了每個(gè)節(jié)點(diǎn)，代碼如下用于可視化上面提到的稀疏圖形的代碼如下這個(gè)圖形非常稀疏，通過(guò)最大化每個(gè)集群的間隔展現(xiàn)了這種稀疏化。 showImg(http://upload-images.jianshu.io/upload_images/13825820-3a550fd2e61e1674.jpg?imageMo...
本文關(guān)鍵闡述了python大數(shù)據(jù)可視化制作趨勢(shì)線和界限統(tǒng)計(jì)圖表，python制作趨勢(shì)線，呈現(xiàn)2個(gè)自變量的關(guān)系，當(dāng)數(shù)據(jù)信息包括多個(gè)時(shí)，應(yīng)用不一樣顏色形狀區(qū)別 一、制作趨勢(shì)線 實(shí)現(xiàn)方案： python制作趨勢(shì)線，呈現(xiàn)2個(gè)自變量的關(guān)系，當(dāng)數(shù)據(jù)信息包括多個(gè)時(shí)，應(yīng)用不一樣顏色形狀區(qū)別?！ ?shí)現(xiàn)代碼： importnumpyasnp importpandasaspd importmatpl...
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